MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	TGA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
2	NC_019431	TGC	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073261
3	NC_019431	GA	3	6	150	155	50 %	0 %	50 %	0 %	414073261
4	NC_019431	A	6	6	272	277	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
5	NC_019431	ATG	3	9	338	346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
6	NC_019431	AATA	2	8	369	376	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
7	NC_019431	A	6	6	406	411	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
8	NC_019431	TGAT	2	8	476	483	25 %	50 %	25 %	0 %	414073261
9	NC_019431	CAA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073261
10	NC_019431	TGA	2	6	651	656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
11	NC_019431	A	7	7	664	670	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
12	NC_019431	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073261
13	NC_019431	A	6	6	732	737	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
14	NC_019431	A	6	6	742	747	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
15	NC_019431	GAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073261
16	NC_019431	GCA	2	6	899	904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073261
17	NC_019431	AT	3	6	908	913	50 %	50 %	0 %	0 %	414073261
18	NC_019431	CTT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073261
19	NC_019431	AAT	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073261
20	NC_019431	ATT	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073261
21	NC_019431	GAT	2	6	1078	1083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
22	NC_019431	CTT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073261
23	NC_019431	GTG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073261
24	NC_019431	TAA	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073261
25	NC_019431	GTT	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073261
26	NC_019431	AAAT	2	8	1230	1237	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
27	NC_019431	AAC	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073261
28	NC_019431	AATG	2	8	1326	1333	50 %	25 %	25 %	0 %	414073261
29	NC_019431	TAAA	2	8	1347	1354	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
30	NC_019431	TTTA	2	8	1764	1771	25 %	75 %	0 %	0 %	414073262
31	NC_019431	TCG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073262
32	NC_019431	TAT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073262
33	NC_019431	CCA	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414073262
34	NC_019431	TTA	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073262
35	NC_019431	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073262
36	NC_019431	TTC	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073262
37	NC_019431	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073262
38	NC_019431	ACA	3	9	3194	3202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
39	NC_019431	TTGA	2	8	3251	3258	25 %	50 %	25 %	0 %	414073263
40	NC_019431	CAA	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
41	NC_019431	TGA	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
42	NC_019431	GAT	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
43	NC_019431	ATTC	2	8	3453	3460	25 %	50 %	0 %	25 %	414073263
44	NC_019431	TCA	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073263
45	NC_019431	A	7	7	3484	3490	100 %	0 %	0 %	0 %	414073263
46	NC_019431	ATT	2	6	3519	3524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
47	NC_019431	TAT	2	6	3526	3531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
48	NC_019431	CAA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
49	NC_019431	ATT	3	9	3569	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
50	NC_019431	TGA	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
51	NC_019431	ATC	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073263
52	NC_019431	ATCA	2	8	3653	3660	50 %	25 %	0 %	25 %	414073263
53	NC_019431	ATT	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
54	NC_019431	GAT	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
55	NC_019431	ATA	2	6	3723	3728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073263
56	NC_019431	ACA	2	6	3773	3778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
57	NC_019431	GAT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
58	NC_019431	TGA	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
59	NC_019431	A	6	6	3906	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	414073263
60	NC_019431	A	8	8	3964	3971	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
61	NC_019431	A	6	6	3979	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
62	NC_019431	GAG	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073264
63	NC_019431	AAC	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073264
64	NC_019431	TTA	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073264
65	NC_019431	AAC	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073264
66	NC_019431	ATTG	2	8	4123	4130	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
67	NC_019431	A	6	6	4157	4162	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
68	NC_019431	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073264
69	NC_019431	CTCG	2	8	4275	4282	0 %	25 %	25 %	50 %	414073264
70	NC_019431	AGA	3	9	4297	4305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
71	NC_019431	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
72	NC_019431	CAT	2	6	4315	4320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073264
73	NC_019431	TGA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073264
74	NC_019431	A	6	6	4352	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
75	NC_019431	GAA	2	6	4481	4486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
76	NC_019431	GAA	3	9	4589	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
77	NC_019431	A	6	6	4610	4615	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
78	NC_019431	TTGA	2	8	4616	4623	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
79	NC_019431	GTT	2	6	4624	4629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073264
80	NC_019431	TCC	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073265
81	NC_019431	TGC	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073265
82	NC_019431	ACT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
83	NC_019431	GAAA	2	8	5117	5124	75 %	0 %	25 %	0 %	414073265
84	NC_019431	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
85	NC_019431	TTA	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073265
86	NC_019431	AG	3	6	5212	5217	50 %	0 %	50 %	0 %	414073265
87	NC_019431	AGA	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073265
88	NC_019431	AGC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073265
89	NC_019431	TTGC	2	8	5414	5421	0 %	50 %	25 %	25 %	414073265
90	NC_019431	TAG	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073265
91	NC_019431	A	6	6	5597	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	414073265
92	NC_019431	GTTT	2	8	5685	5692	0 %	75 %	25 %	0 %	414073265
93	NC_019431	TTA	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073265
94	NC_019431	GCAA	2	8	5834	5841	50 %	0 %	25 %	25 %	414073265
95	NC_019431	TCCCA	2	10	5851	5860	20 %	20 %	0 %	60 %	414073265
96	NC_019431	GAA	3	9	5953	5961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073265
97	NC_019431	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	414073265
98	NC_019431	TCA	2	6	5993	5998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
99	NC_019431	TCA	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
100	NC_019431	GGA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073265
101	NC_019431	T	6	6	6271	6276	0 %	100 %	0 %	0 %	414073265
102	NC_019431	ACG	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073265
103	NC_019431	AGT	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073265
104	NC_019431	TATT	2	8	6449	6456	25 %	75 %	0 %	0 %	414073265
105	NC_019431	TTC	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073266
106	NC_019431	TA	3	6	7924	7929	50 %	50 %	0 %	0 %	414073266
107	NC_019431	CGT	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073266
108	NC_019431	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	414073266
109	NC_019431	AGC	2	6	8186	8191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073266
110	NC_019431	ATCC	2	8	8233	8240	25 %	25 %	0 %	50 %	414073266
111	NC_019431	TTTGAT	2	12	8276	8287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414073266
112	NC_019431	TTTTTC	2	12	8328	8339	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414073266
113	NC_019431	GAT	2	6	8344	8349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073266
114	NC_019431	TG	3	6	8390	8395	0 %	50 %	50 %	0 %	414073266
115	NC_019431	ATA	2	6	8462	8467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073266
116	NC_019431	AAT	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073266
117	NC_019431	TGAAA	2	10	8821	8830	60 %	20 %	20 %	0 %	414073267
118	NC_019431	ATG	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073267
119	NC_019431	AAG	2	6	9015	9020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073267
120	NC_019431	TAG	2	6	9028	9033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073267
121	NC_019431	TGT	2	6	9121	9126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073267
122	NC_019431	TCAT	2	8	9162	9169	25 %	50 %	0 %	25 %	414073267
123	NC_019431	TCA	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073267
124	NC_019431	AAAATT	2	12	9313	9324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073267
125	NC_019431	T	6	6	9388	9393	0 %	100 %	0 %	0 %	414073267
126	NC_019431	GTG	2	6	9398	9403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073267
127	NC_019431	TAA	2	6	9424	9429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073268
128	NC_019431	A	6	6	9428	9433	100 %	0 %	0 %	0 %	414073268
129	NC_019431	GAA	2	6	9477	9482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
130	NC_019431	T	7	7	9487	9493	0 %	100 %	0 %	0 %	414073268
131	NC_019431	TAG	2	6	9497	9502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073268
132	NC_019431	T	6	6	9582	9587	0 %	100 %	0 %	0 %	414073268
133	NC_019431	A	7	7	9595	9601	100 %	0 %	0 %	0 %	414073268
134	NC_019431	T	6	6	9611	9616	0 %	100 %	0 %	0 %	414073268
135	NC_019431	GAA	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
136	NC_019431	ATT	2	6	9683	9688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073268
137	NC_019431	ATG	2	6	9733	9738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073268
138	NC_019431	CTGA	2	8	9813	9820	25 %	25 %	25 %	25 %	414073268
139	NC_019431	GAA	2	6	9825	9830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
140	NC_019431	AT	3	6	9908	9913	50 %	50 %	0 %	0 %	414073268
141	NC_019431	CAA	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073268
142	NC_019431	TCA	2	6	10056	10061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073268
143	NC_019431	ATG	2	6	10129	10134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073268
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145	NC_019431	TCA	2	6	10349	10354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073268
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158	NC_019431	A	6	6	11108	11113	100 %	0 %	0 %	0 %	414073268
159	NC_019431	T	6	6	11159	11164	0 %	100 %	0 %	0 %	414073268
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162	NC_019431	A	6	6	11316	11321	100 %	0 %	0 %	0 %	414073268
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166	NC_019431	TCT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073269
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251	NC_019431	GTT	2	6	19151	19156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073275
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253	NC_019431	AGT	2	6	19257	19262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073275
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256	NC_019431	CTT	2	6	19356	19361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073275
257	NC_019431	TCTTT	2	10	19368	19377	0 %	80 %	0 %	20 %	414073275
258	NC_019431	ATA	2	6	19387	19392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073275
259	NC_019431	TTC	2	6	19795	19800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073276
260	NC_019431	T	6	6	19848	19853	0 %	100 %	0 %	0 %	414073276
261	NC_019431	T	6	6	19913	19918	0 %	100 %	0 %	0 %	414073276
262	NC_019431	ATCTTT	2	12	19963	19974	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073276
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